首先很多人都不明白為什么碇司令為什么要把他的豬手伸進(jìn)去女神那里，難道就是因為色？關(guān)于這里動畫里面沒有交代，只有那個在不斷的在尋找什么都畫面，而然因為當(dāng)初加持帶回來的亞當(dāng)胚胎就融合在那手中。
所以后來被拒絕了之后手被推了出來那個痛苦的樣子，畢竟真的手上的肉還真的被活生生的撕了下來，不痛才怪。
好了回歸正題，想引發(fā)第三次沖擊就必須要亞當(dāng)?shù)谋倔w和使徒的融合才能夠進(jìn)行，而然地下的那個巨人并非亞當(dāng)只是莉莉絲的肉體而且還是沒有靈魂，純粹就是放在那里騙SEELE的老頭們，這就是為何渚薰跑進(jìn)最終教條而沒有任何動作的原因，即使力天使當(dāng)初直接進(jìn)入最終教條也只是撲了個空，兩個司令可以淡定得很。
而綾波麗是使用碇唯的DNA復(fù)制而成的克隆人，但其靈魂并非是碇唯而是莉莉絲換句話來說綾波麗就是百分之百的使徒，因為碇唯當(dāng)初試驗的時候完全的和初號機(jī)融合靈魂已經(jīng)固定了在初號機(jī)當(dāng)中，肉體也已經(jīng)溶解在駕駛室的LCL溶液里，所以她的DNA也是完整的保存在其中。
因為碇唯早就已經(jīng)回歸生命之海這也就是LCL溶液里，當(dāng)全人類都從單獨形態(tài)回歸到LCL溶液的狀態(tài)，靈魂必定會在原始海洋中相遇，這也就是通過這樣的方法再遇到碇唯。
而然唯一不同的是碇司令打算自己成為神這也是和亞當(dāng)融合的原因，因為擁有了智慧果實和生命果實的集合體就是神的存在所以才要和亞當(dāng)融合，希望自己能夠決定人類的未來。但是這馬上就被綾波麗給否定了，剝奪了碇司令手上還沒有完全融合的亞當(dāng)胚胎。
于是冷手撿了便宜的令早就已經(jīng)擁有智慧果實（碇唯的靈魂）和生命果實（吃了力之天使的S2機(jī)關(guān)）的初號機(jī)成為了神，而在駕駛艙里的碇真治擁有決定人類的未來的能力。
假如對碇司令的咸豬手有不同的看法歡迎在下面留言和大家一起分享。
碇源渡將手中的胚胎與綾波麗融合的情節(jié)出現(xiàn)在劇場版《air~真心為你》中，這算是《EVA》老版動畫真正的結(jié)局。
在TV版的設(shè)定中，綾波麗是“莉莉絲的容器”，她的身體是用碇源渡的老婆碇唯DNA克隆培養(yǎng)出來的，用來裝莉莉絲的靈魂。碇源渡對她特別上心，一方面是因為“睹物思人”念自己老婆的舊情，另一方面是想通過綾波麗來控制莉莉絲的意志，以完成自己計劃。。
至于碇源渡計劃的內(nèi)容，還是需要從頭開始解釋：
40億年前莉莉絲隨“黑之月”墜落到日本箱根，這次巨大的碰撞產(chǎn)生的碎片在引力的作用下形成了月球，并被后世稱為“第一次沖擊”。此后LCL液體從莉莉絲的體內(nèi)不斷流出，匯入海洋?？梢哉fLCL是地球生命的最初形態(tài)，而人類也誕生于LCL之海。換言之，莉莉絲是地球上所有人類的“母親”。
另一方面，根據(jù)SEELE在南極發(fā)現(xiàn)的死海文書記載。當(dāng)使徒接觸亞當(dāng)，或者是完整的莉莉絲被EVA處刑，都會引發(fā)“第三次沖擊”造成人類滅亡。
但SEELE信奉的是“人類需要主動贖罪”，如果是使徒引發(fā)的沖擊就算不上是贖罪，所以“人類補(bǔ)完計劃”的一切都圍繞著在約定之日“處刑莉莉絲”來進(jìn)行。所以NERV一邊造EVA阻止使徒入侵，一邊等待“約定之日”的到來。
期間發(fā)生了兩個巨大的轉(zhuǎn)折，第一次轉(zhuǎn)折是SEELE發(fā)現(xiàn)，碇源渡有自己的陰謀，他并不想遵從SEELE的指示殺死莉莉絲。
用SEELE的臺詞來講就是：碇源渡打算讓亞當(dāng)和莉莉絲融合，自己成為“神”。對于成神之后究竟會發(fā)生什么動畫中并沒有多說。但可以確定的一點是，成為了“神”的碇源渡，可以如愿以償?shù)脑俅我姷阶约旱睦掀拧?/strong>這就是碇源渡將亞當(dāng)胚胎移植到手中，又與綾波麗融合的目的所在。
答案說到這也就有了，但事情并沒有結(jié)束。
還有第二次重大的轉(zhuǎn)折，二號綾波麗為了救碇真嗣戰(zhàn)死之后，真正的感情開始覺醒。重新啟用的3號綾波麗，干的第一件事就是想毀掉自己曾視為珍寶的碇源渡的眼睛。從這個時間點開始，綾波麗、以及她代表的莉莉絲的意識，已經(jīng)不是碇源渡所能掌控的了。所以在與亞當(dāng)融合之后，綾波麗舍棄了碇源渡。
最終的結(jié)局是，綾波麗帶著亞當(dāng)?shù)呐咛?，回歸了莉莉絲的本體。“使徒與亞當(dāng)融合”這一條件達(dá)成，莉莉絲有了引發(fā)第三次沖擊的力量。并且她遵從了碇真嗣的意志“要大家一起消失”。
于是第三次沖擊在碇真嗣的催動下發(fā)生了。所有人類的靈魂重新回歸莉莉絲，身體化作LCL之海，一切都回到了人類誕生之前的景象。
不過雖說這種結(jié)局并不是碇源渡的本意，但他還是通過這樣的方式再次見到了唯，完成了自己的愿望。
和綾波麗的身份有一定關(guān)系，綾波麗雖然外型上碇唯很像，但綾波麗斌不是單純的碇唯克隆體，碇唯當(dāng)年在參加初號機(jī)啟動試驗的時候，靈魂留在了初號機(jī)當(dāng)中，而綾波麗是根據(jù)碇唯殘存的肉體提取的 DNA 與亞當(dāng)?shù)?DNA 混合所打造出的人造人，而綾波麗本人的靈魂是 Lilith，準(zhǔn)確說綾波麗是 Lilith 靈魂的容器，釘在最終教條的只是 Lilith 的肉體。于是綾波麗的身份就變成了有著一半第一使徒亞當(dāng)基因，有著一半碇唯基因，靈魂又是 Lilith 的人造人。
司令通過加持良治帶回來的胚胎化的亞當(dāng)，讓亞當(dāng)寄宿在自己的手中，司令的目的和 SEELE 不一樣，司令不是想和 SEELE 那些神棍老頭一樣讓人類重新融為一體再度進(jìn)化，而是想通過亞當(dāng)與 Lilith 的禁忌融合讓自己成為神，在舊劇場版中當(dāng)司令去中央教條的時候，冬月副司令就說了句「替我向唯問好」，司令的目的簡單來說就是讓自己成神，即擁有生命之果又擁有智慧之果，同時還可以與寄宿在 EVA 初號機(jī)中的碇唯再次相見，所以綾波麗和初號機(jī)都是司令實現(xiàn)自己目的重要工具，然而事與愿違最后綾波麗沒有遵從司令的意愿，而是呼應(yīng)了真嗣與 Lilith 融合，讓真嗣去主宰人類補(bǔ)完計劃。
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